南京农业大学历来重视精品课程的建设，2003年颁布了《南京农业大学精品课程建设工作实施办法》（校教字[2003]312号文件），决定从2003年开始以教改立项的方式启动我校精品课程建设工作，规定从2003年开始，每年评审一次校级精品课程和重点课程，连续评审五年，计划评审出300门校级精品课程和重点课程（其中精品课程100门，重点课程200门），并在此基础上择优推荐部分精品课程参加了省优秀课程、课程群的评选和国家精品课程的评选。被评为校级精品课程和重点课程的学校将分别提供课程建设经费8000元和4000元，对获得省级优秀课程和国家精品课程的，学校将提供1：1的配套经费。为了鼓励广大教师积极投身精品课程建设，学校出台了一系列奖励政策，凡是被评为国家级、省级或者校级精品课程，其课程负责人及相关教师将分别按国家级、省级和校级优秀教学成果一等奖给予奖励，奖励金额从50000元到800元不等。同时，课程负责人还将获得课程建设经费10%的奖励。此外，学校还给课程负责人在教学工作量上给予80-200学时的补贴。

　　 以上政策措施的实施极大地调动了我校广大教师参与精品课程建设的积极性。经过2年多的建设（2003年和2004年），我校现在共有校级精品课程42门，重点课程52门，同时，在此基础上择优推荐了部分精品课程参加了省优秀课程、课程群的评选和国家精品课程的评选。在2002年和2004年江苏省省级优秀课程、课程群的评选中，我校共有15门课程获得省优秀课程称号，6门课程群被评为省优秀课程群。在2003年和2004年国家精品课程的评选中，我校共有3门课程被评为国家精品课程，国家级精品课程总门数位居全国农业高校第二。